Από την πρώτη θέση του βάθρου είδε και φέτος ο Καπιρόσι το Motegi, αφού ήταν νικητής και του περσινού GP της Ιαπωνίας. Η παρέα στη δεύτερη και τρίτη θέση είχε ιταλικό αέρα με Βαλεντίνο Ρόσι και Μάρκο Μελάντρι να ανεβάζουν συνεχώς τον ρυθμό τους όσο πλησιάζει το πρωτάθλημα στο τέλος του.
Ο αναβάτης της Ducati, πιέστηκε μόνο στους πρώτους 3 γύρους από τον Μάρκο Μελάντρι αλλά σύντομα απαλλάχθηκε από αυτό το «βάρος» και έμεινε να αγωνίζεται και να σιγουρεύει την 3η του νίκη για το 2006.
Η δύσκολη, στις προσπεράσεις, ιαπωνική πίστα έδωσε μια πιο πικάντικη γεύση στη μάχη του πρωταθλήματος, αφού μόλις 12 πόντοι χωρίζουν τον Ρόσι από τον πρωτοπόρο Νίκυ Χέιντεν που επωφελήθηκε από τις πτώσεις του Στόουνερ και του Νακάνο και τερμάτισε στην 5η θέση πίσω από τον Σέτε Ζιμπερνάου. Την εξάδα συμπλήρωσε ο Τόνι Ελίας που δύσκολα κατάφερε ο Χέιντεν να προσπεράσει.
Ο Ντάνι Πεντρόσα δε φαίνεται να συμπαθεί και πολύ την πίστα, πράγμα που τον άφησε στην έβδομη θέση μπροστά από τους άλλους δύο αμερικάνους Κόλιν Έντουαρντς και Κένυ Ρόμπερτς αλλά και τον δεύτερο «ντόπιο» Μακότο Ταμάντα που συμπλήρωσαν τις 10 πρώτες θέσεις.
Τη πτώση δεν απέφυγε και ο Ράντυ Ντε Πουνιέ αλλά ούτε και ο Χοσέ Λουίς Καρντόσο, χωρίς όμως άσχημες επιπτώσεις για κανέναν από τους δύο.
Β«ΞολοΟΟΞ½ΞΏΟΒ» ΟΟΞΏ ΟΞ―ΟΟ ΞΊΞ¬ΞΈΞΉΟΞΌΞ±! ΞΞ¬Ξ½Ξ΅ΞΉΟ ΟΞΏ αμάξι ΟΞΏΟ
Β«Οαγίδα ΞΈΞ±Ξ½Ξ¬ΟΞΏΟ
Β»;