Ο εργοστασιακός αναβάτης της Honda, Joan Barreda, ήταν ο ταχύτερος τη δεύτερη μέρα και βρέθηκε στην κορυφή του πίνακα των χρόνων.
Τη δεύτερη ημέρα οι αναβάτες του Dakar είχαν να αντιμετωπίσουν μια κυκλική διαδρομή 267 χιλιομέτρων που ξεκινούσε και τελείωνε στο Pisco. Ο Barreda βρέθηκε από νωρίς στην κορυφή, αλλά το προβάδισμά του ήταν της τάξης του ενός λεπτού, με αποτέλεσμα ο Adrien van Beveren να περάσει μπροστά λίγο αργότερα.
Η μάχη της κορυφής κράτησε για τη μεγαλύτερη διάρκεια της ειδικής αφού εκτός από τους Barreda και van Beveren, υπήρχαν άλλοι 5 αναβάτες με διαφορά μικρότερη του ενός λεπτού μεταξύ τους. Τελικά, ο Barreda κατάφερε να ανοίξει τη διαφορά στα δυο λεπτά και τελικά πήρε τη νίκη. Σχεδόν τρία λεπτά πίσω του τερμάτισε ο van Beveren, ενώ ο Matthias Walkner έφερε την ΚΤΜ του στην τρίτη θέση.
Τέταρτος ήταν ο Michael Metge της Honda, ενώ πίσω του τερμάτισε ο Kevin Benavides με τον Pablo Quintanilla να συμπληρώνει την πρώτη εξάδα. Ο νικητής της πρώτης μέρας, Sam Sunderland έχασε αρκετό χρόνο στην αρχή της ειδικής και τελικά τερμάτισε έβδομος, έξι δευτερόλεπτα πίσω από τον Barreda κάτι που τον έριξε στην τέταρτη θέση της γενικής κατάταξης.
Γενική κατάταξη μετά τη δεύτερη μέρα:
1 Joan Barreda Honda 3h18m36s
2 Adrien van Beveren Yamaha 2m30s
3 Matthias Walkner KTM 4m50s
4 Sam Sunderland KTM 5m04s
5 Pablo Quintanilla Husqvarna 5m44s
6 Xavier de Soultrait Yamaha 6m22s
7 Kevin Benavides Honda 6m39s
8 Franco Caimi Yamaha 7m10s
9 Michael Metge Honda 7m33s
10 Toby Price KTM 9m04s