Την πτώση του Sete Gibernau αλλά και το γεγονός ότι νιώθει την Πορτογαλία σαν δεύτερη πατρίδα του εκμεταλλεύτηκε ο Alex Barros, ο οποίος τερμάτισε πρώτος στο Grand Prix του Estoril. O Bραζιλιάνος αναβάτης της Camel Honda κέρδισε και το pole position στα προκριματικά του Σαββάτου.
Παρά το γεγονός ότι ο Sete Gibernau κατάφερε να πάρει το προβάδισμα από την αρχή σχεδόν του αγώνα, οι καιρικές συνθήκες δεν του έκαναν τη χάρη, με αποτέλεσμα να σημειώσει πτώση στον 16ο γύρο. Ο Barros εκμεταλλεύτηκε την ατυχία του Ισπανού με τον καλύτερο τρόπο, οδηγώντας τον αγώνα μέχρι το τέλος, παρά τις φιλότιμες προσπάθειες των Rossi και Biaggi να του κόψουν την ορμή. Ο αναβάτης της Gauloises Yamaha τερμάτισε τελικά δεύτερος, διατηρώντας το προβάδισμά του στη γενική κατάταξη, ενώ ο Biaggi τερμάτισε τρίτος, δίνοντας στη Honda την πρώτη φετινή της θέση στο βάθρο. Ικανοποιητικές, τέλος ήταν και οι αποδόσεις των Marco Melandri και Colin Edwards, οι οποίοι τερμάτισαν 4ος και 6ος αντίστοιχα. Ακολουθούν οι καλύτεροι χρόνοι του Grand Prix του Estoril:
1. Alex Barros - Camel Honda - 47:14.053
2. Valentino Rossi - Gauloises Yamaha - 47:16.824
3. Max Biaggi - Repsol Honda - 47:16.824
4. Marco Melandri - Movistar Honda - 47:43.599
5. Carlos Checa - Ducati Marlboro - 47:43.827