- Αύξηση ισχύος
κατά 3 ίππους
- Κιβώτιο, τύπου
κασέτα, τριών
αξόνων
- Επανασχεδιασμένο
πλαίσιο,
μακρύτερο ψαλίδι
- 40 μοίρες κλίση
κυλίνδρων προς τα
εμπρός
- Νέα σχεδίαση θυρών
εισαγωγής
- Νέοι κοντύτεροι
οδηγοί των βαλβίδων
εισαγωγής
- Νέος τεντωτήρας
καδένας
- Βελτιωμένος
συμπλέκτης
Οταν το 1998 η Yamaha παρουσίασε το πρώτο R1, έπιασε στον "ύπνο" τον ανταγωνισμό, "πυροδότησε" τα όνειρα των οπαδών της αγωνιστικής οδήγησης και σε μεγάλο βαθμό καθόρισε τη μετέπειτα πορεία των μοντέλων της κατηγορίας. Οκτώ χρόνια μετά, το R1 2006 σηματοδοτεί το πέρασμα της σειράς στην επόμενη γενιά, στην οποία διατηρείται ο καθαρόαιμος αγωνιστικός χαρακτήρας. Στον τομέα της εμφάνισης, δεν υπάρχουν σημαντικές διαφοροποιήσεις, καθώς κρίθηκε (δικαίως) πως η εικόνα του R1 παραμένει σύγχρονη και "προκλητική", ικανή να σταθεί επάξια απέναντι στον ανταγωνισμό. Σημαντικές και ουσιαστικές αλλαγές, αντίθετα, υπάρχουν στους τομείς του πλαισίου και του κινητήρα.
Το τμήμα εξέλιξης της Yamaha κατάφερε έπειτα από επισταμένες έρευνες και συνεχείς δοκιμές να επιτύχει βελτίωση κατά τρεις ίππους της μέγιστης ισχύος, και παράλληλα υπόσχεται σημαντική αναβάθμιση στον τομέα της σταθερότητας και της οδικής συμπεριφοράς. Συγκεκριμένα, η ιπποδύναμη του R1 2006 αγγίζει τα 175 άλογα στις 12.500 σ.α.λ., με μέγιστη ροπή 11 kgm στις 10.000 σ.α.λ. (τα αντίστοιχα νούμερα του προηγούμενου μοντέλου ήταν 172 ίπποι/12.500 σ.α.λ. και 10,9 kgm/10.500 σ.α.λ.). Οι ανωτέρω αριθμοί υπολογίζονται χωρίς τη χρήση του ram air, συνεπώς σε πραγματικές συνθήκες οι ίπποι θα ξεπερνούν τους 180. Για τη βέλτιστη σταθερότητα της κατασκευής, της οποίας το βάρος δεν ξεπερνά τα 173 κιλά, αναλαμβάνει δράση το επανασχεδιασμένο σε καίρια σημεία πλαίσιο Deltabox V. Αντλώντας τεχνογνωσία από το αγωνιστικό πρόγραμμα της εταιρείας, το εξωτερικό περίβλημα του αλουμινένιου πλαισίου είναι πιο λεπτό (από 1 χιλ. έως 3,5 χιλ. στο λεπτότερο σημείο), δημιουργώντας ένα στιβαρό και παράλληλα ελαφρύ σύνολο, με μειωμένη ακαμψία μεταξύ βάσεων κινητήρα και λαιμού, το οποίο διατηρεί όμως τα ίδια υψηλά επίπεδα σταθερότητας. Οπως υποστηρίζει η Yamaha, με τη νέα δομή του πλαισίου αναβαθμίζεται ουσιαστικά η συμπεριφορά στις στροφές, όπου το R1 2006 θα έχει πιο άμεσες αντιδράσεις. Παράλληλα, μεγάλη θα είναι η συμβολή στον τομέα της σωστής επαφής με το οδόστρωμα του επανασχεδιασμένου "χρυσού" αντεστραμμένου πιρουνιού, αλλά και του νέου μακρύτερου κατά 20 χιλ. ψαλιδιού, η τοποθέτηση του οποίου μεταβάλλει το "ζύγισμα" της κατασκευής.
Το βάρος στο εμπρός τμήμα του αυξάνεται πλέον κατά 1%, προσφέροντας καλύτερη αίσθηση κατά την γρήγορη οδήγηση.